聖湯瑪斯教堂 Thomaskirche 是德國萊比錫的一座路德會教堂，巴哈長期擔任這座教堂的唱詩班指揮，遺體也安葬於此。
12世紀此處便有一座教堂, 在 1212 年到 1222 年改為奧斯定會的聖湯瑪斯修道院, 1217年，經過多次重建, 1539年五旬節主日，宗教改革領袖馬丁·路德在此講道, 今天，這是一座路德會教堂。
作曲家巴哈從 1723 年至 1750 年去世一直擔任聖湯瑪斯教堂的唱詩班指揮。1908年，教堂旁邊豎起了巴哈雕像。 聖湯瑪斯合唱團目前仍是世界最頂尖的合唱團體之一.
巴哈棺木原來葬在萊比錫聖約翰教堂, 該教堂在第二次世界大戰中被摧毀，1950年，遷到聖湯瑪斯教堂安葬。
這座教堂因爲巴哈的緣故, 生意興隆, 是所有古典音樂愛好者的朝聖地.
